龟头扁平苔藓不是很容易达到根治，但是有一部分患者经过有效的治疗以及调整，可以起到根治的治疗目的。

在临床治疗方面，外用药局部可以涂抹吡美莫司软膏、0.03%他克莫司软膏。但是此类药物有一定的皮肤刺激性，可以在涂抹时先少量涂抹试用，以免大面积涂抹造成龟头出现红肿、灼痛等不良反应。在应用时还可以配合维生素E软膏、氧化锌硼酸软膏，起到一定减缓刺激作用的治疗目的。

在口服药物方面，可以选择雷公藤多甙片、环孢素A软胶囊进行免疫调节的治疗，加速皮疹的好转，以达到根治的目的和效果。