脖子起扁平疣可以从以下几个方面进行治疗：

1、可以去除肉眼可见的疣体，常见的可以使用维甲酸乳膏和干扰素软膏或用激光、液氮冷冻等方式去除肉眼可见的疣体。

2、可以联合胸腺肽肠溶胶囊和转移因子胶囊，提高自身的抵抗力。

3、可以进行光动力治疗。

4、在生活上要注意，毛巾、脸盆等生活用品的暴晒、消毒，不和他人共用，不熬夜，不食辛辣刺激性的食物等，不瘙痒局部，避免造成人为的扁平疣扩散。