心内膜垫缺损是一个先天发育的问题，病因目前尚不明确，可能是由于孕妇在怀孕期间受到了X线照射，或是吃了某些致畸的药物，可能是由于过度劳累所致，也可能没有什么原因，只是由基因变异导致的一种心脏的发育性疾病。

孕妇在怀孕期间需注意不要随便接触X线照射，不要吃过剩的食物或污染的食物。一定要在医生的指导下用药，不可随意服用药物，以免胎儿发生先天性疾病。