目前还没有任何一种的方法或者药物，能够促进房间隔缺损的愈合。但是房间隔缺损也确实有些会发生自愈，尤其是比较小的房间隔缺损，直径小于5mm的，在孩子出生之后半年到一年之内，有可能会发生闭合。这种情况大多发生在单纯的卵圆孔未闭，自我愈合的概率会更高。
而如果房间隔缺损过大或者是已经超过一岁，房间隔缺损依然没有愈合，愈合的概率就非常低了。一般情况下是不会自我愈合的，需要进行手术治疗。当然，如果是非常小的房间隔缺损，对心脏结构、肺动脉压力、心脏功能都没有任何的影响，病人也没有任何的症状，就可以不用治疗。
