CT平扫和薄层CT的区别有很多，包括适用人群不同、检查方式不同、检查效果不同，还有检查时间不同、成像结果不同，对此需要在专业医生指导下，选择合适的CT进行检查。
1、适用人群不同：CT平扫是普通的扫描，适用于初次进行CT检查的人群，针对性相对较弱；薄层CT采用的层厚在1.5-5mm，观察对象较小、更具有针对性，适用于已经发现病灶的情况，多用于非初次检查者。
2、检查方式不同：CT平扫属于常规检查，不需要注射造影剂，而薄层CT为了更好地检出病灶、观察病灶，需要注射造影剂。
3、检查效果不同：CT平扫采用的层厚一般在8-10mm，而薄层CT采用的层厚在1.5-5mm。薄层CT的检查效果更好一些。
4、检查时间不同：由于CT平扫只是普通的常规检查，检查时间相对比较短，可能在几分钟内即可完成。而薄层CT的检查更为仔细，所以检查时间比较长，可能需要半小时左右。
5、成像结果不同：与CT平扫相比，薄层CT检查的成像结果更好，具有更高的分辨率，对病变组织及细微结果显示更好，如果确诊患病，图像也相对比较清晰，更有助于医务人员对于病情进行判断。
需要注意的是，现在全国范围内县级医院，还有县级以上医院的CT都使用的是16排以上CT，常规给患者扫描时都采用的是薄层CT，医生做诊断时观察图像也是薄层CT扫描出来的图像，但给胶片的时候因为薄层图像巨大，又会重建厚层的图像，然后打印在胶片上。