如果是在早孕期发现有右侧的卵巢囊肿，可以根据卵巢囊肿具体的大小、性质，还有症状，决定具体的治疗方法。如果卵巢囊肿本身是良性的，小于5cm，并且复查它的增长速度也很慢，可以随诊观察，不需要药物或者手术治疗，因为怀孕属于特殊时期，尽量不要用药和手术。

但是如果卵巢囊肿大于5cm或者复查增长速度特别快，一般在坐胎比较稳定、没有先兆流产迹象的情况下，建议孕14-16周的时候进行手术治疗，切除卵巢囊肿，可以有效避免在孕中晚期的时候子宫增大导致囊肿破裂，或者蒂扭转的情况发生。如果卵巢囊肿本身的性质属于恶性，不管是不是怀孕期间都要赶紧进行手术治疗。