在月经还有一点点的情况下，建议最好不要做肠镜，等月经完全干净以后再做肠镜的检查。如果是急诊的情况下，可以做肠镜，建议最好是做完肠镜之后，一定要保持外阴局部的清洁，主要是避免感染的可能性。因为毕竟肠镜的镜头是通过肛门进入的，这样在临床上造成阴道感染的机会就有所增加，建议保持局部清洁也非常重要。

所以也建议如果是在临床上做相应的检查，除非急诊的情况下，建议最好是避开月经期再做相应的检查，因为在月经期的时候，体内的一些激素水平会发生相应的变化，机体抵抗力有所下降，所以如果在月经期的时候，如果做一些检查可能会影响到结果，另外也可能会导致感染情况的发生。