月经干净两天之后可以做体检，只要确定月经已经完全干净就不会影响做体检。主要是因为在月经期间不能够做妇科检查，会增加感染风险，如果月经完全干净做妇科检查就没有问题。妇科检查的时候需要进行内诊，需要使用窥阴器了解宫颈和阴道的情况，同时还要取阴道分泌物做检查。

如果月经血没有完全干净就会影响检查的结果，同时会增加感染的风险，因此在做体检的时候建议要避开月经期。体检的时候除了做妇科检查还需要做盆腔B超了解子宫和附件的情况，还需要抽血、拍片等。