脑蛋白水解物口服液在成人及儿童神经内科应用比较多见，而且疗效确切，不良反应较少，对多种原因引起的脑细胞损伤有较好的疗效。大脑细胞对缺氧、缺血比较敏感，而且脑细胞一旦损伤，修复性比较差。

该药的作用机理主要有：它是一种大脑所特有的肽能神经营养药物，可以通过血脑屏障，能以多种方式作用于中枢神经，调节和改善神经元的代谢，具有抗缺氧的保护能力。而且可以促进突触和脑内蛋白质的合成，这就是临床应用广范泛的原因。

可以用于临床治疗的疾病主要有：先天性脑发育不全、中枢神经系统感染、老年性痴呆、颅脑外伤后遗症、脑血管意外后遗症、脑性瘫痪、小儿核黄疸、缺氧缺血性脑病、低血糖脑损伤等疾病。