肠镜的费用，根据做肠镜的方式而有所不同。普通肠镜在二甲医院的费用，一般是300-400元；在三甲医院的费用是500-600元。无痛肠镜，在二甲医院收费为500-600元，三甲医院收费为700-800元。

如果做肠镜的过程当中，需要取病理，可能相应的费用会增加，病理检查费用也会一并收取。还会根据患者所在医院级别的不同而有所不同。一般来说，二甲医院的收费较低，三甲医院的收费会相对较高。