经常肚子疼、腹泻的主要原因有以下几种：

1、肠道的炎症及非特异性肠炎，包括溃疡性结肠炎、克隆氏病等，其主要是由于炎症导致肠道蠕动过快，从而产生疼痛和食物吸收不完全，引起腹泻的症状。

2、肠易激综合征，主要是由于肠道神经功能紊乱，导致肠道的蠕动过快，产生阵发性的绞痛及大便变稀、腹泻。

3、肠道的息肉及肠道的肿瘤，也会产生大便性状的改变，如大便次数增多或大便变细、变稀、不成形，以及大便带血等，可通过腹部CT及肠镜检查进行鉴别诊断。