孕期患有尿道炎应该选择毒性比较小、对胎儿比较安全的抗感染药物，如二代或三代头孢菌素类，或者青霉素类消炎药物，不建议选择喹诺酮类、磺胺类以及四环素类等药物。根据不同疾病选择不同的治疗，包括无症状性细菌尿、急性膀胱炎、急性肾盂肾炎、反复尿路感染等，具体如下：

1、无症状性菌尿及急性膀胱炎：孕期女性患者可采用短程疗法，治疗时间一般在3-7天。

2、急性肾盂肾炎：对于患有急性肾盂肾炎的妊娠期女性，应该静脉注射抗生素治疗，可选择的药物包括半合成的广谱青霉素，如阿莫西林等，或者第三代头孢菌素，如头孢他啶等，疗程通常在14天。

3、反复尿路感染：可以使用呋喃妥因等，进行长程低剂量抑菌治疗，疗程一般在半年左右。