治疗灰指甲可有内服外涂两种方法，内服药物一般选择伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等。外涂药物一般有盐酸阿莫罗芬乳膏、硝酸咪康唑乳膏等。

因内服药物会有一定副作用，如果只是少量指甲患病，则只需外部涂抹即可，涂抹上药前应用白醋泡布甲，以软化指甲，注意把生病的指甲剪除掉。平时要注意不要病甲接触身体各部分皮肤、防止感染。