人乳头瘤39型阳性即HPV39型阳性，仅说明体内存在HPV39型感染，还不能判断是否存在疾病。由于HPV病毒感染可能会引起宫颈上皮内瘤病变及宫颈癌的发生，故应先进行宫颈液基细胞学检查，根据不同结果再进一步判断。

HPV有较多种基因型，不同基因型的HPV感染可导致不同临床病变，高危型别的HPV持续感染是促进宫颈癌发生的主要因素，而39型属于高危型。如果发现HPV39型阳性，需要排除是否患有宫颈上皮内瘤病变，或者宫颈癌。因此，应先进行宫颈液基细胞学检查，若液基细胞学检查异常，需进一步做阴道镜活检，根据病理组织学检查确定。若液基细胞学检查正常，仅是HPV39型阳性，临床认为并不是疾病，仅是病毒感染的一种状态。

由于HPV病毒广泛存在于自然界中，主要通过性传播，多数女性感染过HPV病毒，尤其是在性活跃期的女性，HPV感染率更高，但大部分女性的HPV感染期比较短，呈一过性阳性的状态。一般8-10个月便可自行消失，可被机体自动清除，并不影响身体健康。因此，仅HPV39阳性并不一定是疾病。