磁共振检查是磁场与射频脉冲电信号共同作用的成像方法，无离子辐射的参与，有较大的软组织对比度，能够多平面成像，受胎盘位置和羊水量等因素的影响相对较小，能对超声检查存在的局限性进行有效弥补，有助于医师的诊断及观察。

胎儿MRI扫描的安全性主要有三个影响因素，即磁场强度、射频脉冲和噪声。第一，目前临床普遍应用的磁共振场强是1.5T及3.0T，并已有采用3.0TMRI检查胎儿的报道，但尚未发现MRI检查可以导致胎儿畸形。文献报道即使暴露于8.0T场度的磁场，也不会对人类细胞的分裂、分化和生长产生影响。第二，射频脉冲可以增加温度，温度的增加有可能对胎儿发育产生不良影响，Levine等人做了一个研究，试验了对猪胎行磁共振检查，测量胎脑、羊水及胎腹的温度，发现宫内温度并没有发生明显的升高。为避免潜在的射频热效应危害，在胎儿MRI检查时，一般要求操作者将磁共振的SAR值（specificabsorptionrate）控制在较低水平，SAR值应当小于安全限值3.0。第三，磁共振都会产生固有噪声，1.5T磁共振产生的最大噪声可达120dB，3.0T磁共振部分序列噪声高达131dB，当然，噪声在透过腹部、子宫壁、羊水时会有一定的衰减，但是衰减后的噪声水平是否给胎儿听觉发育带来不良影响尚无定论。

总体而言，中高场强磁共振现在被认为是安全的和有价值的胎儿产前评估工具，但是由于磁场未知的可能的负面作用，并不是每个孕妇都需要做胎儿磁共振。绝大多数的胎儿不需要做磁共振检查，胎儿超声可以明确诊断。胎儿磁共振作为二线的检查手段，主要是弥补胎儿超声的不足，提供一些超声无法提供的额外诊断信息。临床医生应该严格控制胎儿MRI检查的适应证，尽量使胎儿MRI检查目的正当化，磁共振设备的操作者应该保证扫描序列最优化、SAR值及噪声最小化。