巧克力囊肿直径在3-4公分，甚至4公分以上的时候，可能需要考虑手术，但也不绝对，还是要看有没有生育要求，比如说B超非常明确，就是巧克力囊肿，肿瘤标志物都是正常，囊肿在5公分以下，也没有任何症状，如果有生育要求的话可以考虑先怀孕，因为巧囊确实容易影响怀孕，但是一旦怀孕以后，巧克力囊肿会有萎缩的过程。这种情况可以先不考虑手术，因为手术的话可能会损伤卵巢的功能，这不可避免，损伤的程度有大有小，但是确实还是会损伤。

如果没有生育要求，3-4公分就可以考虑手术，如果说继续等的话，有可能会随时发生破裂，一旦巧囊发生破裂的话，就需要急诊手术，而且巧囊破裂后会导致盆腔粘连，这种会增加再次手术的困难程度。另外，也有的人可能肿瘤标志物会增高，这种情况下可能即便囊肿不是很大，为了明确到底是不是良性肿瘤，也需要做手术。所以不光是看大小，还要结合个人其它情况来决定需不需要手术。