HIV感染者在进入艾滋病期后，由于免疫功能低下，容易引起多种机会性感染，出现多种并发症，多种致病病原体，都可以导致肺部的感染。其中肺炎链球菌和流感嗜血杆菌等，可以引起细菌性肺炎，而且可以反复发作，常见的症状有发热、咳嗽、咳痰、呼吸困难、胸痛等，还可以出现脓性痰或血痰，容易合并结核分枝杆菌感染。

结核分枝杆菌感染也是HIV病毒感染者死因的首位，艾滋病患者合并结核分枝杆菌感染时，典型的临床症状是全身性播散性的多器官感染，表现为发热、乏力、盗汗、体重下降、咳嗽、腹痛、腹泻，艾滋病患者也容易合并肺孢子菌肺炎，这是艾滋病患者最常见的机会性感染。肺孢子菌肺炎一般起病比较缓慢，表现为发热、慢性的咳嗽、进行性呼吸困难，由于艾滋病患者免疫功能低下，这些疾病往往容易持续性存在，不容易治愈或反复发作，给治疗增加难度，最终可以导致死亡。