怀孕3个月同房并不一定就会发生流产。只是说在怀孕3个月以内发生了性生活，会增加流产发生的风险。

怀孕3个月以内在这个时期胚胎刚刚着床生长发育处于快速的阶段，而各个器官系统都是处于快速分化发育的时期。在这个时期如果同房了，有可能由于性生活所带来的一些病原微生物，比如细菌、病毒、衣原体、支原体等等。这些病原微生物通过性生活进入女性的生殖道，就有可能造成生殖道的感染。甚至还可能通过宫颈进入到宫腔引起胎儿的感染，所以我们建议在怀孕3个月以内不要发生性生活。在3个月以后，当胚胎已经发育基本完全了，受到外界不良因素的影响相对较小，再逐渐恢复性生活。

另外就是在妊娠期间一旦出现有阴道出血腹痛等等的不正常的现象，都暂时不要有性生活，否则也会增加流产的风险。怀孕3个月同房并不一定会流产，所以如果已经在怀孕3个月的时候发生了性生活，也不要过于担心，注意观察是否有腹痛出血等等的现象，如果没有基本上就不会发生流产。