口腔黏膜黏液囊肿的治疗方法一般包括三种，激光切除，冷冻治疗，和手术切除。手术切除是临床常用手段，一般是门诊小手术，局部浸润麻醉下，将整个腺体组织完整切除以防止复发，术后口服3-5天消炎药，7天左右拆线。口腔黏膜囊肿根据发病部位，一般可分为唇部黏液性囊肿、舌腹黏液性囊肿，以及舌下腺黏液性囊肿。

根据病理分型一般又可分为潴留性囊肿与外渗性囊肿。常见的发病原因一般是因为偶然咬伤或刺破腺体，导致腺泡破裂黏液流出，而迁延不愈形成囊肿。口腔黏膜囊肿常见的发病特征是反复发作、变大、变小的透明水泡形成，反复迁延不愈。因此唇部与舌腹的黏液性囊肿都是建议手术切除，而舌下腺囊肿也是手术切除。但是唇部与舌腹不同，需要摘除整个舌下腺，以防止复发。