逍遥丸的副作用暂时还未有报道，但在使用过程中要注意，切忌生气恼怒。平素月经正常如果突然出现月经量减少，或者月经错后，或阴道不规则出血的要立即到医院就诊。

逍遥丸主要功效是疏肝健脾、养血调经，主要用于肝郁脾虚所致的郁闷不舒、胸肋肿痛、头晕目眩、食欲减退、月经不调等症状。临床主要用于抑郁症、焦虑症、神经官能症、乳腺小叶增生、经前期紧张综合征、更年期综合征、慢性肝炎、慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡等。

逍遥丸对郁闷不舒、胸肋肿痛、乳房胀痛、月经不调的症状有效果，其中的柴胡、当归、白芍，是抗抑郁作用的主要有效成分。现代药理学研究具有中枢神经调节作用和免疫调节作用。

由于抑郁障碍是甲状腺功能减退患者常见的并发症，甲状腺功能减退很大一部分又是由于自身免疫导致的。因而逍遥丸临床也常用于桥本甲状腺炎亚临床甲状腺功能减退时期的治疗。