萎缩性胃炎的药物治疗，包括以下几方面：

第一、是弱酸的治疗，可以采用如米醋或10%的稀盐酸，同时还可以服用胃蛋白酶合剂，多酶片或复方胰酶片，以改善消化不良的症状。

第二、选用抗幽门螺杆菌治疗的药物，因慢性萎缩性胃炎时，多伴有幽门螺杆菌的滋生，可以选用阿莫西林、呋喃唑酮片、庆大霉素、黄连素、甲硝唑、四环素、诺氟沙星等。

第三、使用抑制胆汁反流，和改善胃动力的药物，其中考来烯胺散可以结合反流至胃内的胆盐，防止胆汁酸破坏胃黏膜屏障，硫糖铝可以予以胆汁酸及溶血卵磷脂结合，也可用于治疗胆汁反流，同时也可以使用熊去氧胆酸。

改善胃动力的药物包括胃复安（甲氧氯普胺片）、吗丁啉（多潘立酮片）、快力、西沙必利等药物，以增强胃蠕动，促进胃排空，协助胃十二指肠运动，防止胆汁反流，调节和恢复胃肠功能。

第四、增加黏膜保护剂，常用的药物有硫糖铝、前列地尔注射液。

第五、五肽胃泌素注射液和激素，五肽胃泌素注射液除促进壁细胞分泌盐、增加胃蛋白酶合成分泌外，还对胃黏膜及上消化道黏膜的增殖作用，可以治疗低酸、无酸，或有胃体萎缩的慢性胃醋酸泼尼松片治疗。