小便尿后有疼痛多半是有尿路感染，特别是女性，如果不注意个人卫生，在经期或者性生活后容易引起尿路感染，更年期女性免疫力下降也特别容易引起尿路感染。

如果是男性，可能存在包皮过长、包茎，要注意包皮口或者是尿道口龟头处有没有皮疹、红肿，如果有相应的情况也需要注意个人卫生。

建议小便尿后有疼痛的患者多喝水，不能因为小便痛就怕喝水、怕小便，大量饮水后小便里的细菌容易随着尿液排出。同时可以到医院去检测尿常规，如果尿液里有白细胞增加或者略有红细胞，证实存在尿路感染，同时可以做B超检查明确是否存在肾积水或者尿路结石。

如果仅仅是尿路感染，可以口服左氧氟沙星等抗生素，达到杀菌、灭菌的目的。另外也可以配合服用中成药，如热林清或者尿感宁颗粒，也可以减少尿路感染发生的几率，饮食上清淡，不能喝酒、不能吃辣，注意休息，一般吃药一周后尿路感染的症状就能够缓解。