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支原体引起的呼吸道感染，如果患者病情比较轻，属于健康人群，可以不用抗支原体的药物治疗。
轻度的患者，可以通过自身的免疫力清除支原体，达到临床自愈。但如果患者本身是免疫功能低下的人群，或者病情较重，有明显的高热，病程比较长，需要应用抗支原体的药物治疗。另外，如果支原体已经引起肺炎，一般需要应用抗支原体的药物治疗。
此外，对于支原体的感染，如果引起泌尿生殖道的感染，也需要应用抗支原体的药物治疗。因为泌尿生殖道的支原体感染，病程相对比较长，容易引起复发。如果完全靠自身免疫力清除支原体，不一定都能够完全清除。泌尿生殖道的支原体感染，通常需要应用抗支原体的药物治疗。而且疗程一般比治疗呼吸道的疗程长，否则过早停药，会导致患者复发。
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