头疼肚子疼是原因非常复杂，有以下几种可能性：

1、如头疼是偏头疼、丛集性头疼，颅压高引起的头疼，脑出血引起的头疼等，都会伴随着有消化道的症状，如恶心、呕吐、肚子疼等。

2、患者也可能是胃肠型感冒，可以出现肚子疼甚至上吐下泻，伴有发热、头疼等症状。

3、头疼和肚子疼可能是不同疾病同时发生，头疼有头疼的特殊的原因，肚子疼有胃肠道的感染、阑尾炎等原因。头疼、肚子疼，可以是胃肠型感冒，也可能是消化道的症状伴有头疼、发热等情况，也可能是头部的疾病，如偏头疼、中风等，发生头疼后，伴随着消化道的症状而肚子疼等。

患者应该及时的就诊，很可能要在多学科的医师的指导下进行必要的检查，找到确切的病因以后，对因治疗再加上对症的治疗等综合措施。