色素性扁平苔癣的病因不十分清楚，有以下几种观点：

1、感染源病毒学说，扁平苔癣伴发慢性病毒性肝炎、单纯疱疹病毒II型感染、梅毒等，有些病例在感染控制以后扁平苔癣的皮肤损害也随之好转或痊愈。

2、神经精神假说。

3、免疫学异常，以细胞介导的免疫反应为主，继发或伴随体液免疫反应。

4、扁平苔癣和某些疾病有关，例如扁平苔癣患者，可以同时患有斑秃或白癜风，有的患者也可以伴有红斑狼疮、类天疱疮等自身免疫性疾病。

5、扁平苔癣与遗传免疫缺陷的关系尚待研究。

色素性扁平苔癣，临床表现以无症状的，边界移行的蓝灰色或暗灰色斑为特点。大多数患者皮肤损害在面部、上肢、上背部及腹部，少数患者为全身性分布。耳前和前额也可以受累。腋部和头顶秃发区比较少见，一般不侵犯黏膜和掌跖，皮肤损害常常对称分布。

目前关于色素性扁平苔癣的形态，其描述仍然以损害的边缘可以模糊或清楚，或有隆起红斑的边缘被多数作者所承认。色素性扁平苔癣的皮肤病理改变为扁平苔癣的病理改变，但是常常伴有明显的色素失禁，真皮浅层噬色素细胞增多。

扁平苔癣的治疗是一个比较复杂和困难的问题。多种药物，例如抗生素、免疫调节剂、抗疟药等等，都有一定的疗效，但是效果不是很理想。扁平苔癣的病期不同，有自限性。局部可以外用糖皮质类固醇激素的乳膏封包治疗，也可以口服抗组胺药止痒。