基因扩增指细胞内染色体上的某一个基因选择性地拷贝数大量增加的现象。在生物发育、肿瘤发生的过程中，可以见到基因扩增的现象。
生物发育见到的基因扩增，是一种天然的现象，是生物进化过程中含有基因的DNA片段复制的过程，也称为染色体复制或基因复制，是进化过程中遗传物质复制的主要机制。
肿瘤发生过程中见到的基因扩增，可能与基因DNA片段修复或复制错误等有关。肿瘤细胞的基因组不稳定，肿瘤细胞基因扩增是癌基因激活的主要机制，在人类许多恶性肿瘤的发生、进展中有重要的作用。肿瘤细胞基因扩增，癌细胞被激活会使肿瘤细胞大量增加，逃避生长抑制或产生耐药性。有些肿瘤的扩增片段以某一基因的扩增为主，如神经母细胞瘤中的 MyeIV基因，有些则包含一系列基因的共扩增，如 11q13在乳腺癌中有CCND1和 INT2／FGF3等共扩增。无论扩增区域包含一个还是多个基因，其长度都远大于其中特定的基因。
