干槽症的病因有多种学说，目前均不能全面解释干槽症的发病及临床表现。干槽症的病因是综合性的，起作用的不是单一因素，而是多因素的综合作用结果。
1、感染学说：干槽症实际上表现为骨创感染，多数学者认为干槽症是一种混合感染，厌氧菌起重要作用。
2、创伤学说：认为创伤在干槽症病因中起重要作用，许多研究认为创伤为干槽症的主要发病因素之一。
3、解剖因素学说：此学说认为下颌磨牙区有较厚的密质骨，致使该部位血液供应不良。
4、纤维蛋白溶解学说：此学说认为拔牙的创伤或感染，会引起骨髓炎症，将血凝块中的纤溶酶原转化为纤溶酶，使血凝块中的纤维蛋白溶解，导致血凝块脱落。同时产生激肽，引发疼痛。
此外，拔牙前后口腔卫生条件差、不注重口腔清洁、拔牙后刷牙漱口，拔牙窝内无血凝块保留者，患病可能性相对较高。
