进行真菌培养时需要根据病变部位取材，怀疑为深部真菌感染时常采取阴道分泌物、痰液、血液等。而怀疑浅部真菌感染，如表皮，常选取皮损边缘的鳞屑，也有通过活检切取皮肤组织块。在临床患者需配合进行以下操作：

1.用阴道分泌物进行真菌培养时患者需要采取截石位，两腿分开，充分暴露会阴部，操作者会用拭子蘸取少量阴道分泌物。

2.使用痰液进行真菌培养时需要患者将痰液咳到指定容器中，然后送检。

3.进行血液真菌培养时则需要抽血，患者需要采取坐位或仰卧位，伸出一只胳膊。检查者会使用采血针刺入静脉，抽取少量血液，采血完毕后需要按压3-5分钟。

4.表皮取材时通常操作者会选取小块的皮肤鳞屑或毛发，患者避免乱动即可，通常无不适现象。