鼻咽的整体结构是一条管道，包括顶后壁、底壁、前壁、侧壁，鼻咽壁由内至外可分为4层，分别为黏膜层、纤维层、肌肉层和外膜层。

1、顶后壁

鼻咽顶壁上方与部分蝶骨体及枕骨底部相邻，后壁位于第1-2颈椎前，顶壁与后壁之间无明显角度，呈穹隆状，常合称为顶后壁。顶后壁黏膜下有丰富的淋巴组织聚集，呈橘瓣状，称咽扁桃体，又称腺样体。

2、底壁

鼻咽的前下方为游离的软腭面，与咽后壁之间的鼻咽峡围成底壁，经此与口咽相通。吞咽时，软腭上提与咽后壁接触，关闭鼻咽峡，鼻咽与口咽暂时隔开。

3、前壁

前壁正中是鼻中隔，包括左右后鼻孔及居于中线的鼻中隔后缘。

4、侧壁

侧壁左右对称，主要结构是咽鼓管咽口和咽隐窝。

咽鼓管咽口：在鼻咽的侧壁，距下鼻甲后端之后约1cm处，左右各有一个咽鼓管咽口，略呈三角形或喇叭形，咽口周围有散在的淋巴组织称咽鼓管扁桃体。咽口前、后各有唇状隆起围绕，此隆起由咽鼓管软骨支撑，两唇向后上方融合，形成隆起，称咽鼓管圆枕。

咽隐窝：咽鼓管圆枕后上方与喉后壁之间的凹陷区，称咽隐窝。