B细胞具有复杂的亚群组成，按照不同的分类方法，B细胞可分为多个亚群，不同亚群具有各自独特的生理功能。根据是否发挥固有免疫或适应性免疫功能，B细胞分为B1细胞和B2细胞两个亚群。

1、B1细胞：B1细胞约占B细胞总数的5%-10%，主要定居于胸膜腔和肠道黏膜固有层中。B1细胞在个体发育胚胎期由胎肝发育而来，具有自我更新能力。小鼠B1细胞表面标志为CD5分子，人B1细胞尚未找到特异性标志B细胞属固有免疫细胞，在免疫应答的早期发挥作用，尤其在腹膜腔等部位能对微生物感染迅速产生IgM抗体，构成了机体免疫的第一道防线。B1细胞表达的免疫球蛋白可变区相对保守，主要针对碳水化合物(如细菌多糖等)产生较强的应答，无需Th细胞的辅助，不发生免疫球蛋白的类别转换。B1细胞所合成的低亲和力IgM能与多种不同的抗原表位结合，表现为多反应性。

在无明显外源性抗原刺激的情况下，B细胞能自发分泌针对微生物脂多糖和某些自身抗原的IgM，这些抗体称天然抗体。

B细胞也能产生多种针对自身抗原的抗体，与自身免疫病的发生有关。慢性淋巴细胞白血病中的B细胞均表达CD5，一般认为其来源于B1细胞2。

2、B2细胞：B2细胞是分泌抗体参与体液免疫应答的主要细胞B2细胞在个体发育中出现相对较晚，定位于外周淋巴器官的滤泡区，也称为滤泡B细胞。在抗原刺激和Th细胞的辅助下，B2细胞最终分化成抗体形成细胞——浆细胞，产生抗体，行使体液免疫功能。初次免疫应答后保留下来的部分高亲和力细胞分化成为记忆B细胞。当再次感染时记忆B细胞可以快速分化为浆细胞，介导迅速的再次免疫应答。B1细胞和B2细胞在表面特征、免疫应答等多方面存在着明显的不同。