导致孩子身材矮小的原因比较多，如遗传、生长激素缺乏症、甲状腺功能减退、性早熟、染色体异常等，主要如下：

1、生长激素缺乏症：这样的孩子身材矮小，但比例匀称、智力正常，由于骨龄落后，所以需要做生长激素检查。

2、甲状腺功能减低：是引起生长矮小比较常见的原因，部分孩子会出现智力明显落后，或者大孩子可能学习成绩差或健身状态不太好，此时需要检查骨龄是落后的，需要做甲状腺功能检测。

3、性早熟：此时性征发育明显提前，会影响到最终身高，出现早长晚不长的情况。还有部分垂体功能低下，需要做垂体相关检查来明确。

4、遗传：部分家族性因素，如部分家庭成员普遍个子比较矮，主要由于基因导致，孩子身高也会受到影响，体质性青春发育期延迟，也称为晚长。

5、染色体异常：如女孩比较多见的特征综合征，由于X染色体缺少导致，可能存在身材矮小、智力正常的情况，还可伴有特殊面容。

此外，还有宫内发育迟缓，可能会延续到孩子未来，影响其身高以及精神心理方面。还有部分全身性疾病，如生后慢性腹泻、长期贫血、胃肠道过敏、结核等引起儿童营养不良、慢性肝肾功能异常、风湿性疾病、炎症性肠病导致的营养不良，以及遗传代谢性骨病等。

很多种原因都可以导致孩子身材矮小，所以如果孩子出现上述症状，一定要及时就医，寻找具体原因。