酪酸梭菌活菌散作为益生菌，在适量服用的情况下，副作用一般较小，滥用益生菌可能导致肠道菌群紊乱并加重消化道不良的症状。

酪酸梭菌活菌散正常使用不容易出现副作用，过量使用或滥用益生菌可能会导致肠道菌群紊乱，进而引发腹泻或便秘等问题。因此，在服用益生菌时，确保在治疗剂量范围内，并且建议使用温度不超过40°C的水来服用，以避免活菌被破坏从而影响治疗效果。

此外，对于正在服用抗生素的患者，建议将益生菌与抗生素的服用时间间隔至少2个小时。同时服用会降低益生菌的功效。不同种类的益生菌，如双歧杆菌、枯草杆菌、布拉氏酵母菌等，各自具有不同的作用。

因此，在选择益生菌时，最好在医生的指导下进行，并进行合理应用。