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最近的研究发现，自闭症与身体和脑部的慢性炎症有关，免疫异常可能在自闭症中扮演了关键的角色。粪菌移植之所以能起到改善自闭症的作用，是因为脑肠轴理论认为，肠道和大脑之间彼此联系彼此影响。并且肠道作为人体最大的免疫器官，因此改善肠道健康能期待降低炎症的作用。
肠道微生态与自闭症之间的关联备受关注，研究表明肠道菌群的种类和数量与自闭症患者的行为和症状存在一定的相关性。因此粪菌移植对改善自闭症有积极作用，基于脑肠轴的理论，只要是通过改善肠道环境的手段，也能达到不错的效果。
因此通过益生菌的干预，可能对改善自闭症症状起到积极的作用。通过补充有治疗作用的益生菌，如脆弱拟杆菌等也有助于改善自闭症患者的行为异常。调整肠道微生态的手段能够为自闭症患者带来一定的缓解，而且越早干预效果越好。
总之，脑肠轴理论提供了一条研究自闭症和肠道微生态关系的新思路，未来的科研工作将进一步深入探索益生菌在改善自闭症症状中的潜在作用，以期为自闭症患者提供更有效的治疗手段和希望。
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