小儿百日咳没有所谓的最好治疗方法，需要在医生指导下进行一般治疗、对因治疗以及对症治疗，出现并发症时注意进行并发症治疗，具体如下：

1、一般治疗：百日咳具有传染性，患儿需要隔离至抗生素治疗5天之后。注意室内的空气流通，温度和湿度适宜。

2、对因治疗：百日咳是百日咳杆菌导致，患儿需要遵医嘱使用抗生素进行对因治疗，如红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等，可以控制感染，用药期间注意不良反应。

3、对症治疗：患儿会出现咳嗽症状，严重时可遵医嘱使用镇咳药，例如氨溴索、复方福尔可定口服溶液等。如果咳痰的症状比较严重，可以遵医嘱使用布地奈德等药物来雾化吸入治疗，可以缓解咳嗽、咳痰等不适症状。

4、并发症治疗：如果出现肺实变或肺不张，需要支气管镜检查及肺泡灌洗处理。

小儿出现咳嗽时一定要及时就医，尤其是伴有鸡鸣样的吸气，需要提高警惕，积极就医和治疗。