北京儿童医院新疆医院前身为新疆交通医院，始建于1984年。2016年，自治区党委、政府整合区内优质儿科医疗资源，将我院规划建设为儿童专科医院，成立并挂牌“新疆维吾尔自治区儿童医院”。2019年，为贯彻落实党中央、国务院关于建设国家区域医疗中心的决策部署，自治区人民政府与首都医科大学附属北京儿童医院经友好协商签订合作协议，合作共建国家儿童区域医疗中心，北京儿童医院全面托管我院并挂牌“北京儿童医院新疆医院”、“国家儿童区域医疗中心”。在上级党委、政府的全面支持下，医院已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级儿童专科医院。医院占地面积2.66万㎡，建筑面积5.84万㎡。开放床位574张，年门诊量30万人次、出院患者1.77万人次，手术5440例。

医院现有临床科室22个（其中内系科室13个、外系科室9个），医技科室8个，儿研所1个。截至2022年6月，在职职工875人，其中医师229人，护士394人，技师61人，药师24人。正高级职称41人，副高级职称71人，中级职称218人，博士及硕士104人。

医院儿科技术团队主体由原自治区人民医院儿科体系组成，历经70余年发展历史，已逐渐发展成为技术力量雄厚、学术梯队合理、儿科亚专业学科齐全的专业技术队伍，在各种常见病、多发病、疑难重症病抢救治疗方面积累了丰富的临床经验。在儿科疑难危重症救治方面，已建立成熟的急救、危重症、神经、血液、心血管、风湿免疫、呼吸、内分泌、儿保等专科，在疆内率先开展癫痫的规范化诊断及治疗、流式细胞学检查、儿童PICC置管技术、肾脏活检病理诊断等多项诊断及治疗技术，危重症救治能力强，抢救成功率高达95%以上。积极开展小儿腔镜微创手术，微创治疗腔内疾病达90％以上，治愈率达90%以上，使原有的开放手术模式逐渐向腔镜微创手术模式过渡。其中胆总管囊肿、胆道闭锁、肝叶切除、纵隔肿瘤、肾盂输尿管成形、膀胱输尿管再植等小儿微创手术以及泌尿系结石内窥镜诊治填补了疆内多项空白。2008年，在全疆范围内率先开展危重新生儿转运工作。近10年，分别前往博州地区、巴州地区、和田地区、阿克苏地区、吐鲁番地区、石河子、昌吉地区等20多家医院转运，共转运800余名危重新生儿，最大转运半径达1500公里，成功转运最小孕周25周600g新生儿，无一例死亡，危重新生儿转运救治等方面居全疆领先水平。

医院坚持区域性合作，战略性发展思路，构建新疆儿科分级诊疗体系，建设国家儿童区域医疗中心，是新疆儿科医联体牵头单位、儿科疑难危重专科联盟、新疆新生儿专科联盟的主体单位、中国新生儿神经重症监护联盟单位、全疆危重新生儿转运救治中心。

医院是国家、自治区儿科专业住院医师规范化培训基地、儿科医师转岗培训基地、县级骨干医师培训基地、国家级小儿外科专科医师培训基地、新生儿围产期医学专科培训基地，是新疆医科大学和石河子大学医学院临床教学医院、研究生导师单位。拥有全疆唯一一家儿科研究所，系自治区儿科研究所，在儿科临床医学科学研究方面，尤其在围产期母婴TORCH感染、麻疹感染流行和免疫问题研究、疱疹病毒8型感染的研究、呼吸道感染病原学筛查及其相关基因分析研究等领域处于我国相关研究领域前列。近五年先后承担国家省部级科研课题24项，自选课题24项，全国协作课题30项，荣获国家级科技奖4项，自治区级科技奖16项，中华预防医学会科技进步奖2项。

着眼未来，医院将坚持公益性质和为人民服务的宗旨，始终“关注儿童、关注健康”，积极践行公立医院改革，实施科学、规范、制度化的三级专科医院管理模式，充分利用国家儿童医学中心，北京儿童医院的优质医疗资源，辐射带动区域儿科事业高质量发展，为建成“立足新疆、面向西北、辐射中亚”的国家儿童区域医疗中心而努力奋斗。

2019年，为贯彻落实党中央、国务院决策部署，国家发展改革委和国家卫生健康委牵头开展区域医疗中心试点建设工作，主要目的就是“优质扩容、深度下沉”。国家医学中心和区域医疗中心建设作为全面推进健康中国建设的重大工程，已经纳入国家“十四五”规划，具有极其重要的战略意义。新疆是区域医疗中心建设8个试点省区之一，我院是首批10个试点项目之一。2020年，我院“国家区域医疗中心”正式揭牌，医院迈入全面建设区域医疗中心新征程。

工作启动以来，自治区党委、政府高度重视我院区域医疗中心建设工作，马兴瑞书记、艾尔肯·吐尼亚孜主席实地调研了区域医疗中心建设情况，并就加快项目建设做出重要指示批示。自治区分管副主席牵头建立工作协调推进机制，多次召开专题会议，研究解决问题并提出具体的工作要求，在机构设置、人员编制、综合改革、财政资金等方面给予全面支持和保障。将医院列为自治区卫生健康委员会所属公益二类事业单位，核定事业编制420名；印发《区域医疗中心综合改革试点方案》，提高0-6岁医疗服务价格；落实保障资金8.1亿元（其中，转移支付中央预算资金3亿元、拨付地方政府专项债券3.1亿元、一般债券1.4亿元、向北京儿童医院支付管理费6000万元）。我院在建的“区域医疗中心建设项目” ，内容包括建设集急诊、急救、重症为一体的综合病房楼，同步开展设备采购和信息化建设。总投资6.2亿元（基建3.96亿元、设备采购1.69亿元、信息化0.55亿元），其中中央预算内投资4.8亿元。综合病房楼建筑总面积5.05万㎡，框剪结构、地下3层，地上16层，建筑高度70.2米。目前，基建工作已进入内部装修阶段，有望2022年底投入使用，届时院区内改造和硬件建设水平将大幅度提升。

北京儿童医院发挥“国家队”作用，坚持“统一管理、资源共享、独立经营、分开核算”的管理原则，成立理事会，落实“双主任制”，全面托管医院，实施一体化管理要求，初步建立起服务质量、数量、患者满意度和经营业绩等为核心的管理目标绩效考核体系。在医疗技术方面，通过派驻专家团队、新技术、新项目、传帮带、手术示范教学等方式，向我院输出人才、输出技术、输出品牌、输出管理，扎实推进医疗服务同质化管理步伐。2022年上半年，北京儿童医院派驻专家25名，其中管理专家10名、技术专家15名，工作范围覆盖至我院规划发展、学科建设、人才培养、科研教学、基础设施建设、信息化建设等方面。

医院依托北京儿童医院优质学科资源助力学科发展，加强重点学科建设，带动其他科室共同发展，快速提升了医疗技术综合服务水平，区域医疗中心建设取得初步成效。目前，医院已开设儿内、儿外等22个临床科室、开展26个学科的诊疗工作。开展新技术、新项目41项，其中连体婴儿分离术、神经母细胞瘤综合治疗等14项技术填补疆内区域诊疗技术空白。

2022年上半年，门诊诊疗14.76万人次，同比增长8.1%；0-18岁以下（含18岁）患儿诊疗8.76万人次，同比增长19%；手术2938例，同比增长15.44%；出院0.9万人次，同比增长-3.23%。病种覆盖率67.72%、同期增长30%，核心技术开展覆盖率30.16%、同比增长0.79%，出院患者三级、四级手术比例62.09%、同比增长17.57%。

借助北京儿童医院国家医学中心的地位和作用，医院下沉优质医疗资源，搭建全疆儿科医疗服务体系，建立“北京儿童医院-新疆医院-基层医院”三位一体的立体式远程诊疗模式，通过医联体、专科联盟、远程会诊、社会公益项目等多种平台，采用坐诊、查房示教、疑难病例讨论、专家手术、适宜技术推广等多种方式，使优质医疗资源惠及基层儿科需求，辐射带动全疆儿科整体专技水平的提升。截止目前，医院与疆内医疗机构累计签约医联体52个、专科联盟62个，已覆盖15个地州、39个县市。