鄂尔多斯市中医医院始建于1983年，是一所集中医医疗、预防、康复、保健为一体的综合性三级甲等中医医院。医院占地2.7万平方米，建筑总面积5.4万平方米，编制床位480张，开放床位424张，年门急诊人次33万人次，年住院人次1.1万人次。医院现有在职职工613人，其中高级专业技术职称人员121人，博士研究生2人，硕士研究生69人；全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师1人，自治区名中医3人，硕士生导师1人，鄂尔多斯市名中医14人。医院学科配置齐全，开设了33个一级临床科室；20个行政职能科室，14个护理单元，13个医技科室。现有自治区中医特色优势重点专科6个（针灸科、妇产科、肾病科、脾胃病科、脑病科、骨伤科），自治区中医特色优势重点专科在建设项目2个（肿瘤科、心血管病科），自治区中医临床重点在建专科2个（中医老年病科、中医肺病科），市级重点学科2个（康复医学科、肿瘤科），市级重点专科9个（肿瘤科、皮肤科、脾胃病科、肺病科、心血管病科、骨伤科、内分泌病科、儿科、肛肠科）。

医院设备齐全，拥有飞利浦64排128层CT、西门子X射线计算机体层摄影设备（CT）、西门子1.5T核磁共振、西门子医用血管造影X射线机(DSA)、GE和西门子DR、上肢康复机器人、经颅磁刺激仪等设备。