福建医科大学孟超肝胆医院是一所集医疗、教学、科研和新技术研发于一体的大专科小综合三甲专科医院，是福建省规模最大的以肝胆胰等疾病与感染病为主要防治和研究任务的医疗综合体，也是国内唯一一所以吴孟超院士名字命名的公立医院。
医院始建于1947年，长期承担各种肝病、肝癌、肾脏(泌尿系统)、消化系统相关疾病和感染病的诊治、培训、会诊和教学任务。现有2个院区，西洪院区占地47亩，金山院区占地171亩。拥有国家肝癌科学中心福建分中心、国家肝病与肝癌协同创新中心、中科院物构所转化医学中心、国家中医药防治感染病重点研究室、科学家精神教育基地等7个国家级平台和省肝胆医学中心、省肝胆胰肿瘤临床医学研究中心、省联合创新重点实验室、省肝病防治新技术重大研发平台、东南肝胆健康大数据研究所、省肝病医疗联合体、省肝胆疾病防治产业技术创新研究院、省细胞治疗技术工程研究中心等11个省级平台落户建设，在肝癌及胆胰肿瘤综合治疗、肝胆胰微创治疗、三镜联合复杂肝胆管结石诊疗、病毒性和非病毒性肝病综合治疗、肝病介入治疗、中西医结合肝病、肾脏(泌尿系统)相关疾病的内科治疗及内镜下微创治疗、肝肾移植、新发输入型感染病等防治方面形成特色，具备与国内先进单位同步开展新技术的能力，总体水平达到国内先进，并辐射我国东南部地区和东南亚国家及地区。
近年来先后获评全国红十字模范单位、省级文明单位、省五一劳动奖状、省模范职工之家、全省卫生系统先进集体等称号。