中国中医科学院西苑医院济宁医院始建于1959年，是第五批国家区域医疗中心建设项目，国家三级甲等中医医院、国家中医住院医师规范化培训基地、省级区域中医医疗中心建设单位、齐鲁中医药优势专科集群牵头单位、山东中医药大学非直属附属医院和济宁医学院等5所院校教学医院。
目前，针灸科为国家中医药重点专科，心血管科、脑病科、肾病科、脾胃病科、内分泌科、康复科、推拿科、治未病科、护理学等9个专科为省中医药临床重点专科。现有齐鲁中医药优势专科集群牵头专科1个、成员专科9个。
医院现有高级及以上职称159人、硕士及以上学历208人；现有院士传承工作室1个、国医大师传承工作室8个、全国名中医药专家传承工作室1个、省市级名中医药专家传承工作室12个；拥有享受国务院特殊津贴专家1人、全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师2人、全国优秀中医临床人才1人、齐鲁卫生与健康领军人才1人、省优秀中医临床人才2人、省级中医药名医13人、市级中医药名医20人、市名老中医药专家5人、市“杏林名医”5人。
西苑医院济宁医院新院区建筑面积26.1万平方米，建设内容包括门诊综合楼、制剂楼、外科大楼、内科大楼、科研楼、康复楼、国医堂、传染楼等建筑。规划床位1300张，停车位2253个，配置国内一流医疗设备及信息化系统。
西苑医院长期派驻西苑医院济宁医院专家团队，遵循“四个同质”(管理、技术、服务、文化)、“五个共享”(品牌、人才、信息、平台、成果)，全方位开展深度合作，同质化发展，建强“六大专科”(心血管科、脑病科、脾胃病科、老年病科、肾病科、肺病科)；做大“三大中心”(创伤中心、卒中中心、胸痛中心)。全力打造“立足鲁西南，辐射鲁苏豫皖”的全国一流国家区域医疗中心和国际中医药文化交流中心。