南京比较有名的耳鼻喉科是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院，南京医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科是南京医科大学耳鼻咽喉科学博士学位和硕士学位授权点，江苏省耳鼻咽喉科医疗质量控制中心挂靠单位。南京鼓楼医院耳鼻咽喉科是南京市和江苏省临床重点专科；东南大学附属中大医院耳鼻咽喉科已成为学术梯队健全技术力量雄厚的科室。

第一名：南京医科大学第一附属医院-耳鼻咽喉科

南京医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科是南京医科大学耳鼻咽喉科学博士学位和硕士学位授权点，江苏省耳鼻咽喉科医疗质量控制中心挂靠单位，江苏省临床重点专科，江苏省135工程医学重点学科，江苏省科教兴卫工程医学重点学科，世界卫生组织预防聋和听力减退合作中心，HI-IFOS-ISA江苏耳科与听力中心，江苏省耳科疾病与听力障碍诊治中心，并且是国家首批住院医师规范化培训耳鼻咽喉科专业基地，中国医师协会住院医师规范化培训耳鼻咽喉科专业骨干师资培训基地。

第二名：南京鼓楼医院-耳鼻咽喉科

南京鼓楼医院耳鼻咽喉科是南京市和江苏省临床重点专科，目前为南京大学博士学位授予点。拥有设备完善的临床听力检测中心、眩晕诊断中心和嗓音疾病诊治中心和内镜诊疗中心以及激光、射频手术室，临床设备完善，全方位多层次开展耳鼻咽喉临床诊疗。

第三名：东南大学附属中大医院-耳鼻咽喉科

东南大学附属中大医院耳鼻咽喉科已成为学术梯队健全技术力量雄厚的科室。科室设备齐全，具有先进的日本产Olympus纤维喉镜、德国Storz动态喉镜及丹麦产Madson纯音测听、声阻抗、听觉脑干诱发电位、耳声发射、真耳测量仪等听力检测设备。主持及参加了多项省部级及校级课题的科研工作,主持编写了江苏省卫生厅«医疗机构医务人员三基训练指南耳鼻咽喉科分册»和«三基训练题库耳鼻咽喉科分册»。

第四名：东部战区总医院-耳鼻喉科

东部战区总医院耳鼻喉科目前主要设备有：蔡斯显微镜系统、鼻窦内镜系统、喉内镜系统、施美德全动力系统、德国气道食道窥镜系统、接触式激光仪、VNS前庭检查系统、动态喉镜、电子喉镜、全套听力检查系统、低温等离子射频仪等，设备居国内领先水平。多次举办国际、国内学习班。多次参加国际、国内各种学术活动。科室发表论文数百篇，获科研奖10余项，主编及参与编写专著10余本。

第五名：南京市第二医院-耳鼻喉科

南京市第二医院耳鼻喉科拥有综合动力系统、鼻咽喉内窥镜系统、电子鼻咽喉镜工作站、低温等离子手术系统、睡眠呼吸检测系统，听力损伤鉴定仪等医疗设备。不仅能开展耳鼻咽喉科各类常规疾病的诊断及治疗，还开展鼻内窥镜鼻窦炎手术、鼻息肉手术、鼻中隔矫正手术、鼻出血微创内镜手术、上颌窦根治术、鼻腔及鼻窦肿瘤切除术等。

第六名：江苏省中西医结合医院-耳鼻喉科

江苏省中西医结合医院耳鼻喉科形成了鼻内镜外科、嗓音外科和耳显微外科三大优势外科，具有治疗鼻渊、喉瘖、耳聋、耳鸣、眩晕、鼾眠等常见疾患的中医诊治特色，特别是在头颈部肿瘤的早期诊疗方面独具特色。参与或主持多项国家及省市级自然科学基金项目；参与国家级自然科学基金课题。

第七名：南京医科大学附属江宁医院-耳鼻咽喉科

南京医科大学附属江宁医院耳鼻咽喉科为南京市医学重点专科、中国听力健康联盟单位、长三角过敏疾病防治联盟委员单位。目前科室分咽喉头颈外科、鼻科、耳科、门诊内镜中心、门诊临床听力中心、门诊免疫检测和治疗中心等六个亚专业学组，拥有先进的奥林巴斯NBI电子鼻咽喉镜、艾克松动态喉镜等这杯。专科特色技术为NBI鼻咽喉镜检查及活检术、婴儿耳廓畸形无创矫正技术。

第八名：南京市口腔医院-耳鼻咽喉科

南京市口腔医院耳鼻咽喉科，是南京市口腔医院的新兴、颇具特色的科室，多次参加国际及国内各种学术活动，科室发表论文数十篇，获科研奖多项。日前科室配有Leica微手术系统、美墩力耳皇吸喉科手术动力系统、进口皇内镜手术系统、喉内窥镜系统、Olympus电子皇咽喉喉镜Allmam射频治疗仪、ERBE电疑仪、美国SandmanExpress睡监测系统(60导)、耳皇咽喉综合治疗台等设备。

第九名：南京市中西医结合医院-耳鼻喉科

南京市中西医结合医院耳鼻喉科，是医院特色优势科室，设有南京中医药大学耳鼻咽喉科学教研室，拥有市级、省级、国自然等多项科研课题。科室有一系列进口高清的动态喉镜、纤维喉镜、鼻内窥镜及耳内镜等耳鼻咽喉科内镜设施，还具有中医特色诊治所需要的针灸针、拔罐、电磁理疗灯等设施。