上海呼吸科前三甲医院比较厉害的是上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院。

上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸科是国家临床重点专科，技术创新与科研实力雄厚。复旦大学附属中山医院呼吸科底蕴深厚，引领物联网医学与肺结节诊治领域发展。复旦大学附属华山医院呼吸科亚专科齐全，危重症救治与肺血管病诊疗独具特色。

1、上海交通大学医学院附属瑞金医院 呼吸科

是国家临床重点专科、国家教育部重点学科（内科学），2012年全国医院最佳专科排名第9名，2010年获上海市呼吸内科质控检查第1名，连续10年获评先进集体。在孙桐年等知名教授带领下，多次率先开展国内前沿诊疗技术，承担多项国家级重大课题，参与制定多项呼吸疾病诊疗指南，获多项上海市科技进步奖，在突发公共卫生事件中担负重任，综合实力广受认可。

2、复旦大学附属中山医院 呼吸科

由吴绍青教授于上世纪30年代创立，是国内最早的肺病学研究室，首批国家临床重点专科、上海市“重中之重”临床重点学科。多位教授在无创通气、肺结节诊治等领域作出开创性贡献，白春学教授率先提出“物联网医学”概念，牵头制定亚太肺结节诊治指南。拥有多个国家级、市级科研平台，获国家科技进步奖等多项荣誉，在呼吸危重症、肺部肿瘤等五大亚专科领域实力领先。

3、复旦大学附属华山医院 呼吸科

始建于1956年，是国家PCCM规范化培训优秀基地，拥有多个诊疗中心，是上海市医学会呼吸病学专科分会肺血管病学组组长单位。李圣青教授带领团队在新冠疫情中创造多项重症救治“首例”，总结的华山模式获肯定。在肺血管病介入、肺小结节早期诊断、肺癌精准诊疗等领域特色鲜明，承担多项国家级课题，发表多篇SCI论文，牵头制定相关疾病诊断标准，综合诊疗水平顶尖。

4、上海交通大学医学院附属仁济医院 呼吸科

是上海交通大学医学院博士授予权学科、上海市呼吸专科培训基地，也是上海市医学会间质性肺病学组组长单位。以肺癌综合诊治、间质性肺病、慢性气道炎症性疾病等为核心特色，配备先进诊疗设备，常规开展支气管镜各类活检、经皮肺穿刺等多项诊疗技术。新冠疫情期间，科室骨干奔赴抗疫一线，圆满完成医疗保障任务，在相关疾病诊疗领域积累了丰富经验，行业认可度高。

5、上海交通大学医学院附属第九人民医院 呼吸内科

前身为1951年始建的肺科，是上海交通大学医学院呼吸疾病研究所组成单位，2023年STEM排名全国第54位。重点发展呼吸内镜与经皮介入技术，可开展冷冻肺活检、肺部肿瘤消融等前沿项目，擅长良恶性气道狭窄、早期肺癌等疾病的微创治疗。承担多项国家级、市级课题，获发明专利2项，发表多篇SCI论文，是上海市专科医师规范化培训基地，教学与科研实力稳步提升。