赣州男科相关科室医院排名靠前的是赣州市人民医院男性医学科、赣南医学院第一附属医院男科、赣州市立医院泌尿外科等。赣州市人民医院男性医学科是江西省公立医院中唯一独立建制的男科专业学科，技术水平位列省内各级医院前列；赣南医学院第一附属医院男科熟悉男科常见病、多发病、疑难病的诊治，在多类男科疾病治疗方面具有显著优势；赣州市立医院泌尿外科1989年就在全市最早引进体外冲击波碎石机，已开展经尿道前列腺电切术等术式数千例。

1、赣州市人民医院 男性医学科

该科室是江西省公立医院中唯一独立建制的男科专业学科，技术水平位列省内各级医院前列，在省内首先开展显微镜精索静脉结扎术、保留脉管的隐匿性阴茎矫正术、胡桃夹综合征的手术治疗、精囊镜检治疗顽固性血精及射精管口切开治疗射精管口梗阻性无精症。该科室有3项新技术项目通过市卫生局验收，已完成省卫生厅课题2项、省科技厅课题2项、市科技局课题4项，在省级、国家级及核心期刊发表论文总计30余篇。该科室是中国性学会基层泌尿男科副主任委员挂靠科室，2019年被中国性学会授予“中国包皮环切手术江西基地”，2020年被赣州市医学会授予“赣州市男性医学科质量控制中心”，配备德国蔡司S88显微镜等多类高端男科诊疗设备。

2、赣南医学院第一附属医院 男科

该科室熟悉男科常见病、多发病、疑难病的诊治，诊疗范围覆盖前列腺疾病、生殖整形、生殖系统感染、先天性生殖器官发育异常等多个方向，尤其在前列腺炎、前列腺增生、包皮过长、包茎、包皮龟头炎、隐睾、先天性无睾症、睾丸炎、附睾炎等男科疾病的治疗方面具有显著优势。

3、赣州市立医院 泌尿外科

该科室能紧密跟踪国际、国内的先进技术，1989年在全市最早引进体外冲击波碎石机并设有体外震波碎石中心，1992年在全市率先开展同种异体肾移植术，1996年在全市最早引进前列腺汽化电切镜及前列腺电切镜，已开展经尿道前列腺电切术和经尿道膀胱肿瘤切除术数千例，对老年良性前列腺增生症患者的治疗积累了丰富的经验。该科室近十余年来开展了经腹膜后腹腔镜下各类泌尿系统疾病手术、经皮肾镜气压弹道碎石术、尿道内切开治疗尿道狭窄及闭锁等多项新技术新项目，近几年在国家级及省级学术刊物发表论文近10篇，完成科研课题6项，现有3项科研项目正在推进中，配备OLYMPUS高清腹腔镜、男性性功能检测仪及性功能康复治疗仪等先进设备，设有独立的泌尿外科手术间、膀胱镜室及尿动力学检查室。

4、宁都县人民医院 泌尿外科

该科室是宁都县医疗重点发展科室之一，专业技术水平、专科规模、手术量及业务收入在院内均处于领先水平，配备进口腹腔镜、电子输尿管软镜、膀胱镜、前列腺电切镜、钬激光、体外震波碎石机等先进医疗设备，设有独立膀胱镜室。该科室可开展经尿道输尿管软镜碎石术、经皮肾镜钬激光碎石术、前列腺电切术、前列腺剜除术、腹腔镜精索静脉高位结扎术、显微镜精索静脉曲张高位结扎术、隐匿阴茎矫正术等多类手术，在女性压力性尿失禁诊疗方面经验丰富，熟练开展经阴道无张力尿道中段悬吊术。该科室与南昌大学第一附属医院、赣州等地大医院多次开展学术交流与技术合作，诊疗范围覆盖泌尿系肿瘤、泌尿系结石、尿路梗阻、男性不育及性功能障碍等多类泌尿男科相关疾病。

5、信丰县人民医院 泌尿外科

该科室是医院重点发展科室之一，拥有大功率钬激光机二台、等离子电切镜、德国输尿管镜、经皮肾镜及清石系统、B超定位体外碎石机、红外线结石分析仪等先进设备，可开展泌尿系肿瘤、泌尿系结石、前列腺增生、泌尿系感染、男性生殖器整形、男性性功能障碍、男性不育等多类泌尿男科疾病的诊治。该科室长期致力于结石病的防治，形成了B超引导下微创经皮肾穿刺取石术、输尿管软硬镜钬激光碎石、体外超声碎石等多种先进手段综合互补的微创治疗体系，是赣州南部泌尿系结石防治的重要基地。该科室以腹腔镜及腔内镜手术为主导的微创手术占手术总量的80%以上，患者术后恢复快，可有效减轻病痛、缩短住院周期。