附件炎是盆腔炎性疾病中的一种，所以药物治疗首选抗生素。
一般抗生素的选择要选择广谱、足疗程的抗菌药物，首选的是三代头孢，例如头孢曲松、头孢哌酮钠舒巴坦钠，配伍抗厌氧菌药物，例如甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等，效果比较好，也能够将大部分盆腔炎症的患者治愈。
存在头孢过敏的患者还可以选择莫西沙星、阿米卡星、氨曲南、克林霉素等进行治疗，具体要根据患者的情况进行药物的选择。