婴儿甲状腺功能减退症，不论什么原因，一旦确诊应该立即治疗，越早治疗越好，所以婴儿甲状腺功能的低下应该是早期确诊、尽早治疗避免对脑部发育的损害。
一旦诊断确诊，应该终身服用甲状腺制剂替代治疗，中间不能停断。
饮食中要注意孩子的蛋白质、维生素及矿物质的供应，对于生出生前三个月开始治疗，预后良好，智能大多数能达到正常。
如果未能及早诊断，在出生后六个月以后才开始治疗，虽然给予甲状腺素可以达到改善生长状况，但是智能仍会受到不同程度的损坏。
因此，应该做到新生儿期就应该及时确诊，并及时相应的给孩子进行治疗，确诊后力争在三个月以内接受正规的治疗。