一侧太阳穴疼可以是原发性头疼，也可以是继发性头疼。如果患者的头疼病史比较长，间断出现，疼一次持续4-72小时，有些人睡一夜觉，第二天就好了，这种可能就是原发性头疼，多半以偏头疼为主。
如果患者既往没有头疼发作，这一次头疼出现之后持续存在，就需要查找一下原因，有没有是颅内什么疾病导致的，比如硬膜下血肿、脑出血、蛛网膜下腔出血、颞动脉炎、颅内的炎症、脑炎、脑膜炎等等，或者一些全身的系统性疾病，发烧或者高血压也都可能会出现，所以需要到医院里进行一下详细的检查来鉴别诊断一下。