小孩子发烧的时候嘴巴里起疱，有以下几种常见的原因：
第一、单纯性的疱疹，单纯疱疹是因为疱疹病毒引起孩子体温发烧，同时嘴巴里可以起疱疹，可以在口角部、口腔黏膜及任何其它部位都可能出现起疱的状态，一般是病毒造成的，适当的进行退热处理或者保持口腔黏膜的卫生清洁，对孩子的这种病情的缓解都会有一些帮助，一般平均3-4天左右这种症状多数会缓解。
第二、疱疹性咽峡炎，在发热过程中可能口腔内、咽峡部出现疱疹，相对来说症状会重一些，发烧有的时候持续会比较长，需要对症的进行退热处理，同时这种咽峡部的疱疹可能会让孩子吞咽出现困难，适当给孩子的饮食尽量清淡一些，避免吃刺激性的食物，造成疼痛感增强。
第三、还有的孩子是因为手足口病造成，发热也是有比较明显的症状，另外可能会出现口腔内的疱疹或者是除了口腔之外，还有手、足部、臀部的疱疹，一般因为病毒造成。
引起的病毒不同可能症状会有所不同，需要根据孩子实际情况对症进行治疗，当然还有其它病因可能引起发烧同时出现嘴巴里起疱，需要根据孩子的实际情况，对症进行治疗。