儿童甲型流感常突然起病，主要症状为发热，体温可以达39-40℃，可伴有畏寒、寒战，多伴有头痛、全身肌肉酸痛、乏力等全身症状。发热持续时间为3-5天，病程为5-10天。
对于高度怀疑或确诊流感的患儿，应尽早积极的抗流感治疗，不应等待病毒检测的结果。发病48小时内进行抗病毒药物的治疗，可以有效缩短发热及住院时间。我国目前获批上市的抗流感病毒药物共有三大类，但主要为神经氨酸酶抑制剂，如奥司他韦、帕拉米韦和扎那米韦。