经常跑步后的头痛大部分是一种良性反应，很多人经过跑步等剧烈运动后会引起头部不适的症状。每个人的人体耐受量不同，表现的症状轻重也不同，所以不要有太多思想负担。
目前主要考虑人体运动后交感神经兴奋，出现出汗心率加快、心脏搏出量较正常增加，颅内外血管扩张而引起的短暂性头痛。一般经休息以后头痛就可以缓解，头痛的性质不剧烈。
还有一种是患者运动以后颅内外血管扩张引起良性偏头痛发作，头痛较第一种类型剧烈，经过休息或口服非甾体抗炎药后会较快缓解，必要时需要由神经专科医生指导治疗。