磁共振检查是急性脑梗非常重要的检查，通过磁共振检查可以明确患者坏死的脑组织部位、大小，以及能对患者的预后做出一定判断。与头部CT相比较，核磁共振没有电离辐射，对人体也没有放射性损害，图像清晰度也比较高，可以清晰观察到患者的脑干、后颅窝病变，比CT要有优势。在脑梗急性期时，在发病的2个小时以内可以通过磁共振弥散加权成像，判断患者的梗死部位，所以急性期的磁共振应用非常广泛。头部核磁共振对神经系统的其他疾病也有重要的诊断意义，比如脑脱髓鞘疾病、脑部肿瘤。