一般磁共振检查时间的长短与磁共振机器、检查部位息息相关，磁共振检查的时间可以从5-50min不等，例如脑血管的磁共振检查时间约5min，腹部磁共振检查时间约20-30min，心脏造影磁共振检查时间约50min。
磁共振检查的时间不尽相同，在进行磁共振检查前应确认患者体内是否存在金属植入物，如心脏起搏器、支架、钢钉、钢板等，若存在金属植入物，则无法进行磁共振检查。