喝酒后第二天拉肚子与慢性肠炎、胃肠功能紊乱、脾胃虚弱有关，酒中含有乙醇，乙醇进入到消化系统后，会对消化系统造成刺激反应，导致肠胃蠕动功能亢进，尤其是本身有慢性肠炎的患者，在出现肠道蠕动亢进后，还伴随有肠道功能受损，这时不仅会出现腹部不适症状，第二天会同时伴有腹泻。
大量喝酒后还会导致人体植物神经功能紊乱，而诱发肠胃功能紊乱。一旦出现肠胃功能紊乱，不仅会出现消化不良，同时还会伴随有腹胀、腹泻等症状。部分人本身有脾胃虚弱现象，而酒本身的温度比较低，喝完后会导致症状更加严重，因此会出现腹泻。在喝酒前最好少量的喝一些牛奶，以保护胃黏膜，并且喝酒时还应避免在空腹的状态下喝，最好吃一些食物后再喝，以减少酒精对肠胃黏膜造成的刺激。